三格化糞池分為三大部分，為隔艙板上下錯層設計，污水環流式流動，污水處理能力比同等容積的傳統化糞池至少提高二倍以上。
　　一、沉淀腐化區
　　對生活污水進行沉淀，比重大的物質沉入池底進行化糞處理，比重小的部分浮于水面上層，可從清理口撈出，同時廢水產生化糞作用，使一部分結構復雜的難分解的有機物被降解為易分解的物質。
　　二、隔板區
　　將直流水轉成環流水，增加污水在池體內的滯留時間，使污水在池內與沉淀污泥的接觸時間更長，產生更多的微生物，對污水進行分解吞食。
　　三、過濾器處理區
　　采用國內外先進的生物膜法處理技術，經過一定時間培育，大量微生物在過濾器表面繁殖形成生物膜，污水與過濾器表面的生物膜接觸，有機物被微生物截圖，吸附和分解，實現對污水凈化處理。